由中国科学院信息化工作领导小组办公室主办、中国科学院计算机网络信息中心承办、中国科学院超级计算环境青岛分中心暨中国科学院海洋研究所协办的第一届中国科学院超级计算应用大会(SCA2011)今日在青岛开幕。我团队论文《服务于微生物群落研究的高性能元基因组数据分析平台》获得大会优秀论文第一名。第一作者苏晓泉现场接受中国科学院信息化工作领导小组领导颁奖。
中科院超级计算应用大会联合中国科学院超级计算环境8家分中心和17所级中心,为中国从事超级计算应用的科学家和学者们搭建相互沟通、经验分享的大舞台,促进中国超级计算应用成果产 出,成为培育中国超级计算机领域的诺贝尔奖—贝尔·戈登奖(Gordon Bell prize)的摇篮。
在科技部863、中国科学院信息化E-Science等项目的资助下,我团队计算生物学小组宁康副研究员负责)的研究人员自主开发的服务于微生物群落研究的高性能元基因组数据分析平台,采用并行化算法和系统架构,将传统的元基因组分析方法运行速度提高了十倍以上,实现了对高通量元基因组数据的高效分析,大大提高了元基因组的研究效率。目前,该平台正支撑着国内外近30个产学研单位与团队的合作研究,并将为生物能源、环境生物监测与治理、营养与健康等领域进行更深、更广层次的微生物过程研究和应用开发发挥重要作用。
相关研究论文:
Xiaoquan Su, Jian Xu and Kang Ning. A High Performance Metagenomics Analysis Platform for Research of Microbial Community. SCA2011, 2011.
Xiaoquan Su, Jian Xu and Kang Ning. Parallel-META: A High-Performance Computational Pipeline for Metagenomic Data Analysis. BMC Systems Biology, 2011, accepted.
Xiaoquan Su, Jian Xu and Kang Ning. An Open-source Collaboration Environment for Metagenomics Research. IEEE e-Science 2011, 2011.